مقامات پاکستانی در چند دهه گذشته با مهاجران افغان رفتار نادرست داشته اند و آنان را با مشکلات زیادی مواجه کرده است.
دستگیر شدن از سوی پولیس، ضرب و شتم و اخاذی ها به بهانه های مختلف، مواردی است که افغان های مقیم پاکستان همه روزه با آن مواجه هستند.
اخیراً وزارت امور مهاجرین و عودت کنندگان گفته است، ۵۳ تن افغان از زندان کراچی پاکستان آزاد شده اند، اما قونسل افغانستان در پاکستان تعداد افراد آزاد شده از زندان کراچی را ۱۰ تن یاد کرده است.
عبدالجبار تخاری، قونسل افغانستان در کراچی می‌گوید:« یک ماه پیش ۱۰ زندانی به شمول یک زن و چند کودک از زندان‌های مختلف ایالت سند آزاد و به کشورشان فرستاده شدند، اما بنا به دلایلی در مسیر راه، از سوی حکومت پاکستان بازگردانده شده بودند. با تلاش دوباره ما آزاد شدند و به کشور بازگشتند.»
اگرچه پاکستان در سال گذشته صدها هزار خانواده مهاجر افغان را به اجبار به افغانستان بازگردانده است، اما هنوزهم تعداد زیادی از افغان‌ها با خانواده‌هایشان در این کشور زندگی می‌کنند.
تحلیلگران سیاسی رفتار نظامیان پاکستانی در قبال پناهجویان افغان را اقدام خلاف قوانین بین المللی خوانده و از حکومت سرپرست می خواهند که در این مورد با پاکستان صحبت کند.
شهسوار سنگروال، تحلیلگر سیاسی می‌گوید:« این اقدام خوبی است، اما باید برای هزاران افغانی که هنوز در آنجا زندانی هستند، به خاطر همدردی انسانی و همسایگی، آنها نیز آزاد شوند. من فکر می کنم که آزادی آنها ممکن است راه را برای روابط سیاسی بین دو طرف نیز باز کند.»
برخی دیگر می‌گویند، پاکستان همیشه در مسائل افغانستان دو رو بوده و در همه زمینه ها از جمله مهاجرین به تعهدات خود عمل نکرده است.
ظاهر بهاند، تحلیلگر سیاسی می‌گوید:« هزاران مهاجر افغان روزها و شب های خود را در زندان های مختلف پاکستان می گذرانند. بیشتر آنها مهاجرانی افغانی هستند که به دلیل نداشتن مدارک یا نبود مدارک بازداشت شده اند.»
مهاجران افغان مقیم پاکستان بارها به رسانه ها گفته اند که سربازان پاکستانی به بهانه تفتیش به خانه های آنها رفته و آنها را دستگیر می کنند.
به گفته این مهاجران، آنها مدارک قانونی برای زندگی در پاکستان دارند، اما همچنان به بهانه های مختلف مورد آزار و اذیت قرار می گیرند.
